Este é provavelmente o controlador ata na placa-mãe. Tudo está correndo muito devagar?
Vale a pena iniciar com um USB ao vivo e verificar se os erros ainda estão aparecendo. Eu tive o mesmo problema, recebi os erros mesmo sem HDDs conectados.
ata3 é provavelmente o drive de DVD. Se você remover fisicamente o drive de DVD, os problemas param? Isso não resolve a execução da sua unidade de DVD, mas deve fazer com que o resto do seu computador funcione melhor.