Bem, as atualizações de software não devem tocar seus arquivos pessoais. As atualizações de software tentam usar arquivos de configuração antigos, mas nem sempre. Você deve ficar bem, mas eu, pessoalmente, ao olhar para a transição de dezenas de pacotes importantes, eu ainda me pergunto se uma nova instalação não está muito longe, então eu faria backup do meu material de qualquer maneira.