Algumas opções.
com exif :
sudo apt-get install exif
cd to/folder/
exif --remove *
com exiftran :
sudo apt-get install exiftran
cd to/folder/
exiftran -d *
Com jhead :
sudo apt-get install jhead
cd to/folder/
jhead -purejpg *
Com exiv2 (para suporte a vários formatos):
sudo apt-get install exiv2
cd to/folder/
exiv2 rm *