Não, nada será modificado no lado do Windows, a menos que você, como usuário, execute uma ação para fazê-lo.
Eu estava apenas imaginando - será que algum mal pode ocorrer no meu computador ao executar o Ubuntu em um pendrive? Obviamente, isso exclui coisas como uma instalação do Ubuntu infectada ou trojans escondidos no USB. Assumindo que a instalação estava perfeitamente segura e limpa, algum dano poderia resultar disso? Em caso afirmativo, a probabilidade de tal dano vale a pena se preocupar?
Honestamente, eu não estou muito familiarizado com esse tipo de coisa, apesar de ser razoavelmente alfabetizado no uso do computador, e apreciaria qualquer esclarecimento do assunto.Não, nada será modificado no lado do Windows, a menos que você, como usuário, execute uma ação para fazê-lo.
Não há perguntas estúpidas. Todos nós já estivemos lá .. Bem ... eu ainda estou "lá".
De qualquer forma, não há nada de um USB flasheado no Ubuntu que possa danificar seu computador de alguma forma. (Pelo menos o que eu sei e eu mostrei um monte de computadores).
Se você não tiver feito backup de todos os seus arquivos, recomendo-o antes de começar a experimentar coisas das quais claramente não tem experiência.
Boa sorte!