Antes de mais nada teste seu HDD externo em seu sistema Ubuntu instalado. Há uma chance de que o Ubuntu ainda possa lê-lo. Em caso afirmativo, faça o backup de todos os seus dados (para ter uma cópia pelo menos), volte para o Mac e use o Utilitário de Disco:
Você terá duas opções:
- Se você conseguiu fazer uma cópia: formate seu HDD externo e copie de volta todos os seus dados do local em que você fez o backup.
- Se falhar: peça a um profissional para ajudá-lo. Não tente usar softwares "mágicos" para recuperar seus dados, porque é uma grande chance de destruir seus dados.