Se o tomcat7 do apt instalado corretamente tentar selecionar outro Tomcat installation directory na sua primeira captura de tela, na seção Manually --> . Selecione Apache Tomcat v7.0 e o diretório de instalação deve ser /usr/share/applications/tomcat7 não /usr/share/tomcat7

Senãofortrabalho,façaisso:
Façaodownloaddotomcat7do
Extraia o arquivo baixado em algum lugar. Por padrão, ele faz o download para ~/Downloads :
$ cd ~/Downloads
$ tar -xvf apache-tomcat-7.0.55.tar.gz
Agora, na seção Manually --> da sua primeira captura de tela, escolha o diretório de instalação do Tomcat como /home/$USER/Downloads/apache-tomcat-7.0.55
