Eu só consegui corrigir isso mudando para o uso do driver do touchpad do ChromeOS em vez do synaptic:
$ sudo add-apt-repository ppa:hugegreenbug/cmt
$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install -y libevdevc libgestures xf86-input-cmt
$ sudo mv /usr/share/X11/xorg.conf.d/50-synaptics.conf /usr/share/X11/xorg.conf.d/50-synaptics.conf.old
$ sudo cp /usr/share/xf86-input-cmt/50-touchpad-cmt-peppy.conf /usr/share/X11/xorg.conf.d/
$ sudo reboot