A ferramenta mais comum para fazer isso é Wine (significa W ine i s n de um e mulador). O Wine utiliza programas do Windows e basicamente "traduz" os comandos do Windows para comandos do Linux em tempo real.
O Wine pode ser instalado através dos repositórios oficiais:
sudo apt-get install wine
No entanto, prefiro usar o PlayOnLinux. Esta é uma interface gráfica e gerenciadora do Wine. Ele suporta várias unidades virtuais, uma para cada programa do Windows, para que elas não interfiram umas nas outras. Além disso, o PlayOnLinux suporta várias versões do Wine. Para cada aplicativo, você pode escolher a versão mais usada. E para muitos programas, há um script de instalação que faz todo o trabalho para você.
Instale o PlayOnLinux usando o seguinte comando:
sudo apt-get install playonlinux