Se você está falando sobre atualização de software, então eu recomendo apenas abrir um terminal e rodar sudo apt-get upgrade para atualizar todos os pacotes. Se você está falando sobre a instalação de algo, eu recomendaria encontrar o nome do pacote e digitar sudo apt-get install [package name] , já que achei o terminal muito mais confiável e o log de instalação e instalação deve ser interrompido.