Seu disco rígido deve ter remapeado esses setores por conta própria, mas caso isso não ocorra:
A maioria dos sistemas de arquivos sabe como contornar setores defeituosos, se esses setores defeituosos estiverem marcados como tal. O programa badblocks
faz isso para você, mas não é um programa de GUI.
Outra coisa que vale a pena mencionar: seu novo disco rígido não precisa ser fabricado, tenho 99% de certeza de que isso é uma mentira descarada ou uma desculpa ruim do seu revendedor. HDDs são commodities padronizadas e nada de especial.