Veja Usado o software Linux Downloads pasta? para uma pergunta semelhante.
DEB é apenas um contêiner. o comando sudo dpkg -i google-chrome*.deb abriu-o e extraiu os arquivos necessários e os colocou nos lugares certos.
Então você não tem nada para se preocupar. Exclua o arquivo deb. Quando você instala o Chrome dessa maneira, ele é instalado no lugar certo e, a partir de agora, o Ubuntu cuidará da atualização do Chrome.
Você poderia ter aberto o ícone "Arquivo" no Launcher (o painel esquerdo na área de trabalho, supondo que você esteja usando o Unity) e clicar duas vezes no arquivo deb. Ele teria aberto o Ubuntu Software Center e você veria um Install lá. Instalar um arquivo deb em uma dessas duas maneiras (comando sudo dpkg.. ou GUI Software Center) sempre instala o software em seus lugares corretos. É melhor não mexer com isso e tentar instalar o software em uma pasta diferente.
Espero que isso ajude