Resolveu:
Houve alguns problemas com a sintaxe, mas também, eu estava tentando executar a partir do mongodb.exe, e a importação precisava ser executada a partir do nível bin $, assim: -
jon@ubuntu:~/Desktop/mongodb-linux-x86_64-2.6.3/bin$ mongoimport --db jontestcsv --collection Aircraft --ignoreBlanks --type csv --headerline --file /home/jon/Desktop/Aircraft.csv