Deve ser bom usar lightdm para selecionar o fluxbox. Em seguida, para corrigir o problema nauitlus
instale o gnome-tweak-tool
sudo apt-get install gnome-tweak-tool
então, use o comando
gnome-tweak-tool
na área de trabalho, procure por "o gerenciador de arquivos controla a área de trabalho" e verifique se essa opção está desativada
veja aqui link