Eu tenho o mesmo problema. Quando os fones de ouvido estão conectados ao conector frontal, o ubuntu automaticamente desliga os alto-falantes. Não é configurável a partir do alsamixer ... quando a tomada frontal está conectada, funciona apenas na tomada frontal. Eu sou muito frequentemente usando alternar entre fones de ouvido para alto-falantes, no Ubuntu 12.04 funciona de forma programática, mas em 14.04 só pode desligar a tomada frontal, para usar alto-falantes. É realmente frustrante, por que não é configurável?
[EDITAR]
Em alsamixer Modo Auto-Mute [Ativado / Desativado] funcionou para mim, ele alterna fones de ouvido e alto-falantes, quando o conector frontal está conectado, como um encanto.