Sim. Se você baixar o Ubuntu usando o navegador da web ou torrent, você deve obter um arquivo Ubuntu.iso ou algo parecido (o Ubuntu vem no arquivo .iso, que pode ser gravado diretamente em um CD usando o software de gravação de CD).
Tudo que você precisa fazer, depois disso, é instalar o pendrive Linux (não tenho certeza se ele está disponível no Mac) e você pode instalar o arquivo iso no pendrive.