Bem, não. Essa é a estrutura do disco do Ubuntu e não pode ser modificada.
A imagem principal com todo o conteúdo está em casper/filesystem.squashfs .
A pasta boot contém grub bootloader, portanto, não pode ser removida.
As pastas dists e pool contêm alguns pacotes que o ubuntu instala.
EFI também é importante para computadores mais novos.