Parece-me que suas configurações de compiz precisam ser redefinidas (manualmente). Para fazer isso, remova ~/.compiz-1
, ~/.compiz
e ~/.config/compiz
ou ~/.config/compiz
(se eles existirem; depende da versão do seu compiz).
Além disso, você pode excluir ~/.gconf/apps/compiz-1
para ser seguro.
Desde que você tenha reinstalado o Unity, isso deve corrigir o problema.