Atualmente estou usando o Xubuntu 14.04 e queria testar o Gnome 3, então comecei a instalá-lo e durante a instalação ele está me perguntando qual gerenciador de exibição devo usar por padrão: gdm ou lightdm. Qual deles devo usar? se eu escolher um sobre o outro, isso afetará de alguma forma um dos dois ambientes de desktop (já que eu quero manter tanto o xfce quanto o gnome)?
Ambos funcionarão bem. Você não precisa dos dois instalados, pois gdm é uma recomenda dependência de gnome-shell , não uma dependência difícil. Você pode desinstalar um ou outro, dependendo de como você gosta deles. Eu usei ambos com gnome-shell e não enfrentei problemas por causa deles.