Estou usando um segundo disco rígido para armazenar a maioria dos meus arquivos de dados. Links para arquivos e pastas na segunda unidade de todos os locais na minha primeira unidade, onde o Ubuntu 14.04 está instalado, funciona, exceto que depois de um reboot links na área de trabalho estão quebrados. Os links na minha pasta Home permanecem válidos, o que é estranho, já que a área de trabalho é uma subpasta da minha pasta Home. Eu montei a segunda unidade no aplicativo Startup Applications.
Este é um comportamento diferente do 13.10 (e versões mais antigas), onde os links do Desktop persistiram após as reinicializações.
Eu acho que seu problema de montagem se você tem que montar o segundo disco rígido em cada reiniciá-lo, os links simbólicos certamente serão quebrados para evitar que simplesmente edite
/etc/rc.local
adicione o comando mount ao segundo disco rígido.
se o problema persistir, adicione os comandos de link simbólico no arquivo também para que ele seja criado a cada reinicialização.