Eu vejo isso às vezes também, mas eu geralmente não reinicio o sistema, em vez disso, simplesmente teco Ctrl + Alt + F1-F6 e mova para a linha de comando. Sem fazer nada lá, eu volto para unity desktop apertando Ctrl + Alt + F7 . Isso na maioria dos casos corrige o problema de paralisação e faz as coisas funcionarem normalmente novamente.
Se ainda estiver ligado, reinicie apenas unity e não o sistema inteiro. Quando parado, aperte Ctrl + Alt + F1 , insira as credenciais e faça:
sudo service lightdm restart.
Isso me salvou algumas vezes. Embora no segundo método você de qualquer maneira acabe perdendo todos os documentos e coisas abertas, mas pelo menos você se salva da reinicialização do sistema.