Ok. Aqui está a atualização. Consegui carregar meu sistema com gráficos ativados. Depois de postar esta pergunta, eu re-instalei meu Ubuntu. Eu instalei o Ubuntu 12.04 LTS de 64 bits. Então eu instalei o bumblebee seguindo este post . Tudo funcionou até que eu instalei o freeglut3 usando o comando thise:
sudo apt-get install freeglut3 freeglut3-dev
Eu notei que ele pede para deletar muitos arquivos, bibliotecas que estão relacionadas ao x-server. (Eu só deduzi isso dos nomes dos arquivos que ele pediu para excluir). Eu confirmei. Depois que o freglut3 foi instalado, eu reiniciei meu sistema e tive o mesmo problema novamente.
could not write bytes: broken pipe
could not write bytes: bad file descriptor
Nvidia Persistence daemon [fail]
Eu decidi tentar remover nvidia e bumblebee e reinstalá-los, esperando que ele recarregasse os arquivos que o freeglut3 deletou.
sudo apt-get remove --purge nvidia*
sudo apt-get --purge remove bumblebee
Depois disso, eu adicionei repositórios contendo os drivers nvidia mais recentes e os instalei.
sudo add-apt-repository ppa:xorg-edgers/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install nvidia-331
Após a conclusão da instalação sem reinicializar, instalei o bumblebee
sudo apt-get install bumblebee
Eu reiniciei e meu sistema começou a funcionar novamente! Infelizmente, terei que fazer isso toda vez que algumas atualizações ou novas instalações tocarem em arquivos "X". Espero que este post ajude alguém. Atenciosamente.