No xfce (eu estou usando o Xubuntu) você pode simplesmente clicar com o botão direito na barra acima da janela e escolher "keep on background" (ou algo assim, eu não uso a versão em inglês do meu sistema).
Eu estou usando xpad para notas, mas eu realmente não gosto, que elas apareçam em apenas uma área de trabalho por padrão, então eu configuro para aparecer em todas. Mas com essa configuração, quando eu clico em uma nota, ela fica acima de todas as janelas em todos os espaços de trabalho. Eu pensei que seria perfeito, se eu pudesse fazer o xpad continuar no fundo como conky. Isso é possível? Eu não me importo, se eu tiver que configurá-lo manualmente toda vez que eu iniciar o xpad.
Respostas específicas ao xpad são bem-vindas, mas eu ficaria mais feliz com uma solução geral que funcionaria com qualquer aplicativo.
No xfce (eu estou usando o Xubuntu) você pode simplesmente clicar com o botão direito na barra acima da janela e escolher "keep on background" (ou algo assim, eu não uso a versão em inglês do meu sistema).