Eu me deparei com uma coisa semelhante. Depois de usar o synaptic para encontrar o tema plymouth padrão, cliquei em propriedades para ver quais arquivos foram instalados. Isso listou a maioria dos arquivos que entram nesse diretório
/usr/share/plymouth/themes
coloque todos os seus arquivos lá e então execute
update-alternatives --install /usr/share/plymouth/themes/default.plymouth default.plymouth /usr/share/plymouth/themes/"path/to-your-plymouth.plymouth" 100