1- você precisa baixar o 3DSlicer da web: link para o linux 64bit (o stable é recomendado)
2- você precisa descomprimir este arquivo no seu Desktop, por exemplo.
3- Abra um terminal e dica: Desktop / Slicer-4.3.1-linux-amd64 / Slicer
mudando "4.3.1 ....." para o nome da sua pasta descompactado.
Agora você verá um run 3DSlicer!
Melhor