Isso funciona no Ubuntu 13.10, no Unity, mas com o Gnome instalado (então pode funcionar) .
Você pode ativá-lo em dconf-editor - (procure por desktop com Ctrl + F ) - mas é tão simples de executar - note que os comandos set podem reiniciar o gerenciador de arquivos:
gsettings set org.gnome.desktop.background show-desktop-icons true
Para desligar novamente:
gsettings set org.gnome.desktop.background show-desktop-icons false
Para obter o valor atual:
gsettings get org.gnome.desktop.background show-desktop-icons
Você também pode usar unity-tweak-tool , mas para alterar o que aparece no Área de Trabalho:

Alémdisso,em~/.config/user-dirs.dirs,verifiqueseestalinhaestápresenteeestáseguindoocaminhocerto:
XDG_DESKTOP_DIR="$HOME/Desktop"
Também lembre-se de que você não pode visualizar os arquivos que começam com . ou terminam com ~ na área de trabalho.