Como falconer apontou - basta digitar whereis
hddtemp e adicionar caminho completo ao script. então é parecido com:
* * * * * date >> /home/pana/temperatures.txt; /usr/sbin/hddtemp /dev/sda >> /home/pana/temperatures.txt ;/usr/sbin/hddtemp /dev/sdb >> /home/pana/temperatures.txt ;sensors -A >> /home/pana/temperatures.txt ;printf "_________________________\n" >> /home/pana/temperatures.txt