Sim, o Windows 7 permitirá escolher uma partição para instalação durante o procedimento de instalação. Basta escolher sua partição atual do Windows.
No entanto, o procedimento de instalação do Windows substituirá seu MBR onde o grub está instalado. Isso significa que você não poderá inicializar em seu sistema Linux após a instalação do Windows; seu PC sempre inicializará o Windows. Não se preocupe, no entanto. Seu Linux ainda está lá, você está simplesmente perdendo a opção de inicializá-lo. Tudo o que você terá que fazer nesse momento é usar um Live CD ou USB do Ubuntu e reinstalar o grub usando uma ferramenta como BootRepair
. Isso permitirá que você faça o boot duplo novamente.
Veja aqui para obter instruções sobre como reparar sua funcionalidade de inicialização dupla usando um sistema Ubuntu Live.