Não consegui encontrar uma ferramenta específica para o papel de parede. É configurável, mas você precisa usar a ferramenta gnome-session. Se eu usar isso, toda a área de trabalho do compiz será iniciada. Então recuei e experimentei feh, o que não funcionou para mim porque eu não conseguia definir uma cor de fundo sólida e, além disso, uma imagem centralizada.
Então eu peguei hsetroot . Não foi instalado por padrão em 12.04, mas está nos repositórios. Até agora funciona como esperado e o fundo Unity não apareceu como antes.