bem como você pode facilmente usá-lo com o sudo, basta criar um netbeans.desktop por
sudo gedit /usr/share/applications/netbeans.desktop
e, em seguida, insira estas linhas
[Desktop Entry]
Name=Netbeans
Comment=Netbeans IDE
Exec=env UBUNTU_MENUPROXY= netbeans
Icon=netbeans (or path of your icons .xpm file in the installation folder)
Terminal=false
Type=Application
Categories=Development,IDE;
X-Ayatana-Desktop-Shortcuts=NewWindow
StartupNotify=false
[NewWindow Shortcut Group]
Name=New Window
Exec=env UBUNTU_MENUPROXY= netbeans
TargetEnvironment=Unity
salve-o e reinicie o PC uma vez. pressione a tecla de energia para traço e procure pelo netbeans. espero que funcione, se não registrar, então, como um bug, já que é um problema conhecido no 13.10.