Sim, você pode.
Basta selecionar "algo diferente" (ou similar) ao selecionar a partição a ser instalada no instalador do ubuntu. Na etapa seguinte, você poderá fazer partições e definir pontos de montagem para eles, também se eles estiverem em unidades diferentes. (Para fazer / home e / usr no drive de 1tb, faça duas partições lá e dê a elas os pontos de montagem / home e / usr, faça outro no ssd e dê o ponto de montagem /).
Apesar de 32gb deve ser mais do que suficiente para o Ubuntu. Eu tenho uma partição de 12 GB para o Ubuntu e apenas 7 são usados.