Você não precisa usar o USB para instalar com o Virtual Box. Baixe a versão do Ubuntu que você deseja usar (o arquivo .iso) para o seu disco rígido e, em seguida, monte esse arquivo como uma unidade de CD virtual em sua VM Virtual Box. Em seguida, ele será inicializado a partir desse CD virtual como se fosse um disco real - não é necessária uma unidade de CD / DVD - e o guiará pelo processo de instalação.
Este processo é descrito no manual do primeiro capítulo:
O VirtualBox é muito bom, pois se você nomear a máquina apropriadamente, ela tentará adivinhar o sistema operacional e a arquitetura que você está usando. Por exemplo, eu costumo chamar o meu algo como ubuntu-1204-64 (versão 12.04, 64 bits) para que eu possa facilmente distingui-lo de outras versões e ele irá selecionar automaticamente o sistema operacional correto, arquitetura correta.