Você precisa formatar seu disco rígido para o sistema de arquivos ntfs novamente. Provavelmente agora é ext4 (padrão para instalação do Ubuntu) e é um sistema de arquivos do Windows não suporta.
Existem duas maneiras de contornar isso.
1) Use a ferramenta de particionamento do instalador do ubuntu, apague todas as partições (/, / boot, swap etc). Crie uma nova partição única para todo o disco rígido e certifique-se de gravar suas alterações no disco rígido.
Ou se você tivesse o ubuntu suficiente:
2) Instale seu disco rígido do Ubuntu como um disco secundário em um PC Windows operacional. Vá para o painel de controle / ferramentas administrativas / gerenciamento de computadores. Navegue até Disk Managment encontre seu disco rígido do ubuntu, apague as partições, crie uma nova e formate-a.