Se esses caminhos para os diretórios estão corretos como você diz, então você deve usar:
gnome-terminal --tab -e "bash -c 'cd /ini/experiments/ && gedit mytext.txt';$SHELL" --tab -e "bash -c 'cd /ini/myex/ipython';$SHELL"
Veja também:
-
man gnome-terminal
- Como executar um script sem fechar o terminal?