Se você não tiver certeza, remova a outra unidade. Se você não puder, faça backups. De qualquer forma, ele deve confirmar com você quais unidades / partições estão sendo removidas / alteradas / adicionadas, se o feedback estiver correto, lá você vai, se não estiver, tente usar "Outra coisa".
Então, a verdadeira questão aqui é: o instalador (ubiquity) removerá o que não deve ser removido?
A resposta é: ele remove o que você diz para ele remover e pede para você confirmar.