Eu costumava pensar que isso era apenas um bug do Eclipse, mas persistia mesmo depois de mudar para o IntelliJ Idea. Eu acho que isso acontece em outros programas também, mas com menos frequência e, obviamente, importa muito menos.
Existe alguma solução para isso ou eu só tenho que mudar o sistema operacional ou algo assim? Eu tentei desabilitar o desvanecimento da janela do Compiz, mas isso não ajudou.
SO: Ubuntu 15.10 WM: Qualquer versão da unidade que vem com o acima HW: Dell Latitude E7250 (tela HD sem toque)
Às vezes, tenho uma situação como essa que acontece comigo. Junto com uma versão de diálogo preto igualmente irritante.
Encontrei uma solução na resposta a esta pergunta: 13.10 - Bordas pretas, pretas terminal
O que foi reiniciar a unidade. Pop abrir uma janela de terminal e:
setsid unity
Depois que as coisas se acalmam, a maioria dos problemas de diálogo geralmente parece ter se resolvido.