Eu sugeriria instalar o Ubuntu de dentro do Windows usando um dvd virtual. Use Daemon Tools Lite ou algum outro software de disco virtul para montar a iso que você baixou para um disco virtual, então simplesmente duplique clique no computador (também pode ser executado automaticamente) e siga as instruções de instalação. Você precisa ter uma partição separada. Se você não tem um, o google como encolher seu partiton usando o gerenciamento de disco no Windows.
Eu tive os mesmos problemas que você está tendo com VMWare, e se você quiser a experiência completa do Ubuntu sem os problemas, você deve apenas instalá-lo como um sistema operacional regular, como mencionei acima.