O Linux usa um sistema de arquivos unificado. Portanto, existe apenas um sistema de arquivos (/). Suas partições estão lá como pontos de montagem. Então, a partição 1 é montada como / e a partição 2 é montada como / home (etc.).
Isso pode ser um pouco confuso no início, porque o Windows tem duas unidades como C: e D: mas o Linux as terá como pontos de montagem.
Existem certos pontos strongs e fracos nessa configuração. A maior força individual é que você nunca precisa se preocupar com o que é algo. A configuração está em / etc, não importa se / etc em um disco rígido, uma chave usb, uma calculadora de bolso ou um relógio de pulso, é sempre / etc (e não pense por um segundo que as unidades de montagem não são que diversa porque é). Alguns diriam que a única grande desvantagem é que é mais trabalho se você ficar sem espaço no / usr, se você ficou sem espaço no C :. No entanto, maçãs e laranjas e melhores esquemas de partição resolvem esse problema, e para ser honesto acho mais fácil lidar com isso.
Agora, quanto ao seu esquema de particionamento, eu vou assumir que você leu isso em algum lugar, e fez algum tipo de recomendação. A verdade é que é muito horrível e provavelmente causará problemas sem benefícios.
Você provavelmente deveria ter feito
Partição 1 / partição 2 / home
ou
Partição 1 /
Ter um / home separado é um pouco mais fácil em reinstalar, embora eu prefira backups. O que você fez foi feito um limite artificial (em torno de / usr) que o servidor não tem propósito (você não vai ganhar nenhuma velocidade ou redundância lá no mesmo disco físico).
Tente ler: link para obter mais informações.