Sem passar e listar o número X de Microscópios, posso dizer que a maioria dos microscópios USB são simplesmente câmeras acopladas a lentes. Verificar através da seção Hardware Support do Wiki do Ubuntu também não menciona o suporte do Microscope.
Dito isso, sua melhor opção é encontrar de 3 a 5 modelos diferentes que você acha que são bons para seus usos (e para seus filhos) e então procurar por aquele modelo específico (ou apenas marca) palavra "Linux" ou "Ubuntu" no final. Se você fizer isso, receberá alguns comentários sobre sua compatibilidade.