Você vê caracteres aleatórios ao tentar ler o documento de texto no bloco de notas da Microsoft, certo?
Você tentou ler de volta do Ubuntu? (Se isso funcionar, então é provavelmente culpa do Notepad) Se você não pode verificar a partir do Ubuntu, tente instalar o Notepad ++ no Windows e lendo seu documento de texto com ele.
Como regra geral, eu recomendaria evitar o Bloco de Notas da Microsoft no Windows e usar uma alternativa mais séria, Bloco de Notas2 ou Notepad ++ por exemplo. (O Notepad2 é mais fácil de acessar, mas substitui o Bloco de Notas da Microsoft nos menus do Windows). Isso evita que você sofra muito quando estiver em ambientes que não sejam Windows.