Você pode instalar qualquer kernel que quiser. Não há problema em usar um ou vários Kernels por vez. Mas em algum momento você deve considerar o Mapeamento do Kernel para a sua versão do Ubuntu. Por exemplo, seguindo o link lista o mapeamento do kernel diferente para a versão diferente do sistema operacional:
Você pode obter informações completas sobre a instalação / remoção do kernel a partir do link a seguir. Isso me ajudou muito a instalar um novo kernel no Ubuntu 12.04.2. Agora eu posso escolher qualquer kernel 3.5.0 ou 3.8.0 do menu grub.