Existe um problema como este postado aqui.
Para resumir a questão, pode ser uma de três coisas:
1.Um erro no BAMF (a estrutura de correspondência de aplicativos mencionada acima).
2.A descrição do aplicativo com defeito (também conhecido como arquivo '.desktop').
3. A falta de qualquer descrição de aplicação em tudo. Executáveis que iniciam janelas não possuem inerentemente esses metadados.
Esse problema está diretamente relacionado à estrutura do Unity.
Eu não consigo resumir muito bem, mas se você for ao link acima tem uma explicação completa do problema.