Se você estiver apenas pretendendo usar uma partição, você pode tentar remover a configuração do RAID existente e reinicializá-la pelo Ubuntu. Eu tenho muitos problemas com o meu "fake raid" no Ubuntu também.
Você definiu o seu Raid através do BIOS? Eu tentaria remover isso, e deixar o instalador do Ubuntu configurar sua própria partição raid.
Nota: O instalador pode configurar alguns bons ataques falsos que são automontados na inicialização e em todas essas coisas divertidas, mas, pela minha experiência, outros sistemas operacionais não detectam o ataque, ou seja. Inicialização dupla do Windows não detectaria a partição RAID, apenas os dois discos rígidos.