gpt não é um formato, mas um tipo de particionamento. O Windows é inicializado apenas a partir de unidades particionadas gpt com UEFI. O Ubuntu inicializará com UEFI ou BIOS a partir de unidades particionadas gpt.
Você pode converter, se o particionamento estiver dentro de certas regras de MBR, para que você possa inicializar com o BIOS. Ou, se o sistema for dual UEFI / BIOS, você precisará converter a instalação do Windows em uma unidade flash e adicionar o recurso UEFI.
Convertendo para ou da GPT link Você então precisa usar o gdisk para converter de gpt para MBR link