Difícil de solucionar esse problema com poucas informações. Em primeiro lugar, recomendo comparar os resultados de xinput list
e lsinput
quando o mouse está funcionando corretamente e depois quando o mouse parou de funcionar corretamente.
xinput list - mostrará quais dispositivos de entrada são reconhecidos pelo xorg.
lsinput - mostrará seu dispositivo e suas capacidades (que tipo de eventos pode produzir). Talvez os recursos estejam mudando, por algum motivo estranho que impede os cliques do mouse.