Eu não acho que haja uma maneira fácil de conseguir isso, o Gimp tem alguma funcionalidade para ler de outros dispositivos de entrada, mas eu não acho que você possa misturar livremente e combinar entradas de dispositivos diferentes (veja Edit->Input Devices
e %código%). Não tenho certeza sobre Krite, MyPaint e todos os outros aplicativos gráficos.
O Linux, no entanto, tem a interface de entrada de dados que permite criar dispositivos de entrada virtuais e com isso você pode ler eventos de entrada do seu tablet e seu gamepad e misturá-los em um dispositivo de entrada virtual. No entanto, isso requer alguma programação. Você pode encontrar alguns códigos-fonte de exemplo que podem ajudar você a começar: