O Ubuntu deixou o suporte ao Wubi desde 13.04. Você não pode usá-lo para 13.04 ou mais recente. Eu sugiro que você use 12.10 ou 12.04 LTS.
Eu baixei o Iso para a versão 13.04. Eu montei e tentei executar wubi.exe mas nada acontece. Tentei ambos os 32 bits e 64 versão. Tentei executá-lo com o antivírus desativado, mas nem recebi uma mensagem de erro.
O Ubuntu deixou o suporte ao Wubi desde 13.04. Você não pode usá-lo para 13.04 ou mais recente. Eu sugiro que você use 12.10 ou 12.04 LTS.
Eu estava tendo o mesmo problema quando o meu HDD estava prestes a falhar .. Então, verifique a sua integridade do disco rígido.