Para evitar alguns problemas de inicialização, geralmente recomendo:
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através das ferramentas do Windows, reduza a partição do Windows para 80 GB.
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instale o Ubuntu no espaço restante.
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se algum problema de inicialização, através da ferramenta Gparted, reduzir a partição do Ubuntu para 20GB. O espaço restante pode ser usado para armazenar documentos.
Veja link para mais informações.