Você deve iniciar um processo de correção de inicialização na seção de reparo de instalação do Windows 7
1- Na primeira tela de boot no windows 7 clique em repair
2- Iniciar um processo de reparo automático, na maioria das vezes, encontrar a instalação correta do Windows e funciona ok, mas se ele não conseguiu repará-lo, vá para a etapa 3
3- Abra um console de recuperação e execute
[drive letter]:\fixboot
[drive letter]:\fixmbr
[drive letter]:\Bootcfg /rebuild
deve corrigir o problema.