Esta questão está claramente relacionada com esta .
No entanto, tentei as abordagens sugeridas e nenhuma delas funcionou.
Deixe-me explicar o que aconteceu:
Estou usando um notebook da Asus com uma GPU NVIDIA integrada. No entanto, eu só tenho usado os gráficos da Intel e funcionou bem. Eu precisava do driver NVIDIA para CUDA, então instalei o driver correspondente no site da NVIDIA.
Depois, não consegui logar no Ubuntu com uma GUI, mas apenas no modo texto.
Eu então desinstalei todos os pacotes da NVIDIA. No entanto, acho que quebrei alguma coisa, porque tenho as mesmas caixas pretas em todas as janelas, conforme descrito na questão referenciada.