Este é o comportamento normal absoluto que você espera ao inicializar dualmente. Seu computador só poderá executar um único sistema operacional no momento.
Portanto, sempre que você mudar seu sistema operacional do Windows para o Ubuntu ou vice-versa , você terá que reinicializar. O primeiro dispositivo de inicialização, em seguida, tem que ser a unidade onde você colocou o carregador de inicialização Grub. Talvez seja necessário alterar a ordem de inicialização no BIOS para sempre inicializar a partir da unidade em que o Grub fica.
Caso você precise dos dois sistemas operacionais em execução no momento correto, não há outra alternativa senão colocar um deles em uma máquina virtual instalada no outro sistema operacional.